Два бомбовых отсека, в зависимости от задания может нести до 12т. Свободнопадающих или корректируемых авиабомб или 12 тактических КР, или 6 стратегических КР.
Тяжёлый бомбардировщик Fw.200 предназначен для нанесения ударов по целям в дальнем и оперативном тылу противника, нанесению высокоточных ударов по важным целям, без захода в зону непосредственной ПВО обьекта. Так же имеется разведовательная модификация самолёта. В настоящий момент, прорабатывается возожность оснащения самолёта ракетами ПКО, аналогичными ракетам РКПКО «Крепость», что позволит значительно усилить ПКО систем.